Fabia Battistuzzi

Fabia Ursula Battistuzzi
副教授
340 DH
(248) 370-3593
实验室位置:335B DH
实验室电话:(248)370-2658
battistu@anhkarah.com

课程: 

生物3340进化生物学
BIO 4340进化医学原理
BIO 4342/5382进化生物学主题
功能基因组学和生物信息学
BIO 3343地球与生命共同进化(实地课程)

研究方向:微生物生命进化的速度与模式

我们所知道的生命是惊人的多样化, 有弹性的, 几乎可以适应地球上任何环境. 然而,, 产生数十亿物种的进化的速度(年表)和模式(进化机制)大多是未知的. 博士的目的. Battistuzzi的研究是了解物种何时以及如何进化，并调查它们的基因创新与环境条件变化之间的联系. 在所有物种中, 微生物跨越了地球历史上最长的时间，并且在代谢和生态方面极其多样化. 这些特征使它们成为研究长(数十亿年)和短(数百万年)时间尺度上的进化机制的强大资源，同时追踪重要生态创新的起源，如致病性和传染病的起源. 她的实验室主要项目包括:

• 原核生物的古代进化. 原核生物(细菌和古细菌)以复杂的机制进化，阻碍了对它们的关系(系统发育)和起源时间(分子钟)的清晰理解。. 本研究项目的目的是提高我们对原核生物的古代进化及其与地球尺度环境变化的关系的认识. 
  
  
• 传染病的起源和演变. 许多真核微生物对人类和其他动物具有致病性，可引起疟疾等疾病. 这些疾病起源的历史尚不清楚, 因此, 环境和生态环境有利于它们传播到多个宿主是高度争议的. 在这个项目中, 我试图重建微生物病原体的历史，并利用这些信息来调查他们在遗传水平上的创新. 
  
  
• 生物信息学工具的评估和发展. 现有的和即将到来的分子数据的数量需要重新评估当前的生物信息学工具，以评估它们对非常大的数据集的适用性, 结果的准确性, 以及它们的计算需求. 该研究项目的目标是为生物信息学工具的使用提供改进的指导方针，以解决已建立的研究领域，并开发新的工具来回答日益增长的进化研究人员群体所产生的需求.

这些独立开发的项目中的每一个都推动了生物信息学的发展，而它们的协同效应将导致对生命进化史的更深入理解，这是理解生物圈当前和未来变化的基础. 

选择出版物:

Fabia Battistuzzi NCBI出版名单

鲍威尔* C. 和F. U. Battistuzzi. (2020). 在模拟环境中量化二次与远距离一次校准的误差. 遗传学前沿 11: 252. DOI: 10.3389 / fgene.2020.00252 /全.

Sitto * F. 和F.U. Battistuzzi. (2019). 用Roary估计泛基因组. 分子生物学与进化: 37(3): 933–939. DOI:10.1093 / molbev / msz284.

Superson,.A*, D. Phelan *,. 德科维奇*和F.U. Battistuzzi. (2019). 物种的选择影响深节点的系统发育稳定性:以terrabobacteria为例. 生物信息学 35(19): 3608-3616. DOI: 10.1093 /生物信息学/ btz121.

道,问., K. (F.U. 巴蒂斯图齐和S. 库马尔. (2019). 一种用于检测大型系统发生中进化率自相关的机器学习方法. 分子生物学与进化 36: 811-824. DOI: 10.1093 / molbev / msz014.

Battistuzzi F.U., Q. 道,我. 琼斯* K. 田村和S. 库马尔. (2018). RelTime放松了整个系统发育过程中严格的分子钟. 基因组生物学与进化 10: 1631-1636. DOI: 10.1093对/ gbe / evy118.

乔杜里,年代.*, N. 伦* D. Phelan *,.A. 埃斯卡兰特和F.U. Battistuzzi. (2018). 低复杂度区域的比较分析 疟原虫. 科学报告 8: 335. DOI: 10.1038/s41598-017-18695-y.

马林,F.U. Battistuzzi,.C. 布朗*和B. 篱笆. (2018). 原核生物的时间表:对其进化和物种形成的新见解. 分子生物学与进化 34: 437-446. DOI: 10.1093 / molbev / msw245.

Battistuzzi F.U., K. 施耐德,M.K. D·斯宾塞. 费舍尔,年代. 乔杜里*和A.A. 埃斯卡兰特. (2016). 顶复合体低复杂性区分布. 进化生物学 16:47. DOI: 10 /.1186/s12862-016-0625-0.

*你的学生